Pokemon sind tierartige Wesen, die verschiednen Elementen angehören und in der Wildnis leben. Trainer können sie per Pokeball einfangen und in Kämpfen gegen andere Trainer ausbilden. Manche Pokemon entwickeln sich durch viel Erfahrung in ein anderes, stärkeres weiter. Das Ziel der meisten Trainer ist es, Orden zu sammeln, indem sie ausgewählte Arena-Leiter in verschiedenen Städten besiegen und letztendlich zur Pokemon-Liga dürfen, in der sich die besten behauptet müssen.

Der 11-jährige Ash hat sein erstes Pokemon Pikachu erhalten, dass aber nicht im Ball bleibt, sondern immer mit ihm umherzieht. Die junge Misty hat sich ihnen angeschlossen, deren Fahrrad versehentlich von Ash kaputt gemacht wurde. Sie hofft, es irgendwann ersetzt zu bekommen. Sie werden gute Freunde, liegen sich aber auch ständig in den Haaren. Rocko, ein Arena-Leiter, der sich in jede hübsche Frau verliebt, schließt sich ihnen bald an. Team Rocket (Jessie, James und das sprechende Pokemon Mauzi) machen ihnen oft das Leben schwer, indem sie seltene Pokemon und vor allem Pikachu stehlen wollen.

Ash, seine Freunde und Team Rocket wurden nach einem Schiffsunglück durch einen Wasser-Zyklon auf eine Insel gespült. Die Trainer müssen entsetzt feststellen, dass ihre Pokebälle mit den Pokemon verloren geganen sind.

Die Pokemon erwachen in der Mitte der Insel. Mauzi will Unruhe stiften, doch Rettan und Smogon, die anderen Rocket Pokemon, helfen ihm nicht. Sie erklären, dass Pokemon nur Böses tun wenn ihre Trainer es verlangen. So vertragen sich erst mal alle miteinander und werden ein Team. Da greifen gigantische Pokemon an. Ash und Team Rocket ergeht es genauso. Sie tun sich kurz zusammen und können der Insel entkommen. Da erfahren sie, dass die Giganten nur Attrappen für einen Vergnügungspark waren. Ausgerechnet der Team Rocket Boss ist der Besitzer und hat nun hohe Verluste, weil die Giganten bei der Flucht zerstört wurden.